Protein–RNA interactions for Protein: P60330

Espl1, Separin, mousemouse

Predictions only

Length 2,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Espl1P60330 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Espl1P60330 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Espl1P60330 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Espl1P60330 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Espl1P60330 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Espl1P60330 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Espl1P60330 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Espl1P60330 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Espl1P60330 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Espl1P60330 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Espl1P60330 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Espl1P60330 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Espl1P60330 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Espl1P60330 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Espl1P60330 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Espl1P60330 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Espl1P60330 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Espl1P60330 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Espl1P60330 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Espl1P60330 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Espl1P60330 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Espl1P60330 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Espl1P60330 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Espl1P60330 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Espl1P60330 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Espl1P60330 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Espl1P60330 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Espl1P60330 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Espl1P60330 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Espl1P60330 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Espl1P60330 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Espl1P60330 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Espl1P60330 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Espl1P60330 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Espl1P60330 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Espl1P60330 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Espl1P60330 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Espl1P60330 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Espl1P60330 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Espl1P60330 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Espl1P60330 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Espl1P60330 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Espl1P60330 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Espl1P60330 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Espl1P60330 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Espl1P60330 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Espl1P60330 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Espl1P60330 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Espl1P60330 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Espl1P60330 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Espl1P60330 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Espl1P60330 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Espl1P60330 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Espl1P60330 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Espl1P60330 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Espl1P60330 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Espl1P60330 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Espl1P60330 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Espl1P60330 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Espl1P60330 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Espl1P60330 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Espl1P60330 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Espl1P60330 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Espl1P60330 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Espl1P60330 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Espl1P60330 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Espl1P60330 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Espl1P60330 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Espl1P60330 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Espl1P60330 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Espl1P60330 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Espl1P60330 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Espl1P60330 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Espl1P60330 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Espl1P60330 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Espl1P60330 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Espl1P60330 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Espl1P60330 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Espl1P60330 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Espl1P60330 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Espl1P60330 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Espl1P60330 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Espl1P60330 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Espl1P60330 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Espl1P60330 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Espl1P60330 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Espl1P60330 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Espl1P60330 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Espl1P60330 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Espl1P60330 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Espl1P60330 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Espl1P60330 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Espl1P60330 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Espl1P60330 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Espl1P60330 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Espl1P60330 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Espl1P60330 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Espl1P60330 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Espl1P60330 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Espl1P60330 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 578.2 ms