Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Samsn1P57725 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Samsn1P57725 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Samsn1P57725 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Samsn1P57725 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Samsn1P57725 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Samsn1P57725 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Samsn1P57725 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Samsn1P57725 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Samsn1P57725 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Samsn1P57725 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Samsn1P57725 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Samsn1P57725 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Samsn1P57725 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Samsn1P57725 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Samsn1P57725 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Samsn1P57725 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Samsn1P57725 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Samsn1P57725 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Samsn1P57725 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Samsn1P57725 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Samsn1P57725 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Samsn1P57725 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Samsn1P57725 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Samsn1P57725 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Samsn1P57725 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Samsn1P57725 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Samsn1P57725 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Samsn1P57725 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Samsn1P57725 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Samsn1P57725 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Samsn1P57725 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Samsn1P57725 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Samsn1P57725 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Samsn1P57725 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Samsn1P57725 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Samsn1P57725 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Samsn1P57725 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Samsn1P57725 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Samsn1P57725 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Samsn1P57725 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Samsn1P57725 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Samsn1P57725 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Samsn1P57725 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Samsn1P57725 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Samsn1P57725 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Samsn1P57725 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Samsn1P57725 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Samsn1P57725 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Samsn1P57725 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samsn1P57725 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Samsn1P57725 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Samsn1P57725 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Samsn1P57725 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samsn1P57725 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Samsn1P57725 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samsn1P57725 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Samsn1P57725 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samsn1P57725 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Samsn1P57725 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Samsn1P57725 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Samsn1P57725 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Samsn1P57725 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Samsn1P57725 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samsn1P57725 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Samsn1P57725 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samsn1P57725 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Samsn1P57725 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Samsn1P57725 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms