Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cox17P56394 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cox17P56394 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox17P56394 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cox17P56394 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox17P56394 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cox17P56394 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cox17P56394 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox17P56394 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox17P56394 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox17P56394 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox17P56394 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox17P56394 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox17P56394 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox17P56394 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox17P56394 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox17P56394 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox17P56394 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cox17P56394 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cox17P56394 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cox17P56394 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox17P56394 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cox17P56394 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox17P56394 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox17P56394 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cox17P56394 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox17P56394 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cox17P56394 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cox17P56394 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cox17P56394 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox17P56394 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cox17P56394 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms