Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efnb1P52795 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efnb1P52795 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efnb1P52795 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efnb1P52795 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efnb1P52795 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efnb1P52795 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efnb1P52795 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efnb1P52795 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Efnb1P52795 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efnb1P52795 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Efnb1P52795 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efnb1P52795 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efnb1P52795 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efnb1P52795 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efnb1P52795 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efnb1P52795 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efnb1P52795 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efnb1P52795 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efnb1P52795 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efnb1P52795 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efnb1P52795 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efnb1P52795 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efnb1P52795 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efnb1P52795 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efnb1P52795 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efnb1P52795 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efnb1P52795 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Efnb1P52795 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efnb1P52795 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efnb1P52795 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efnb1P52795 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efnb1P52795 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Efnb1P52795 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efnb1P52795 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efnb1P52795 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efnb1P52795 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efnb1P52795 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efnb1P52795 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Efnb1P52795 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efnb1P52795 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Efnb1P52795 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efnb1P52795 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efnb1P52795 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efnb1P52795 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Efnb1P52795 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efnb1P52795 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efnb1P52795 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Efnb1P52795 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efnb1P52795 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efnb1P52795 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efnb1P52795 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efnb1P52795 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efnb1P52795 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efnb1P52795 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efnb1P52795 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efnb1P52795 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efnb1P52795 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Efnb1P52795 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efnb1P52795 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efnb1P52795 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efnb1P52795 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efnb1P52795 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efnb1P52795 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efnb1P52795 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efnb1P52795 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efnb1P52795 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efnb1P52795 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efnb1P52795 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Efnb1P52795 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efnb1P52795 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efnb1P52795 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Efnb1P52795 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efnb1P52795 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efnb1P52795 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms