Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psen1P49769 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psen1P49769 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Psen1P49769 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psen1P49769 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Psen1P49769 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psen1P49769 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psen1P49769 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psen1P49769 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psen1P49769 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Psen1P49769 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Psen1P49769 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psen1P49769 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psen1P49769 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Psen1P49769 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Psen1P49769 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Psen1P49769 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Psen1P49769 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psen1P49769 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Psen1P49769 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Psen1P49769 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Psen1P49769 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psen1P49769 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Psen1P49769 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Psen1P49769 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Psen1P49769 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Psen1P49769 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Psen1P49769 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Psen1P49769 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Psen1P49769 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psen1P49769 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Psen1P49769 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Psen1P49769 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psen1P49769 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psen1P49769 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Psen1P49769 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Psen1P49769 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psen1P49769 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psen1P49769 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psen1P49769 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psen1P49769 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psen1P49769 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Psen1P49769 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psen1P49769 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psen1P49769 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psen1P49769 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psen1P49769 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psen1P49769 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psen1P49769 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psen1P49769 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psen1P49769 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psen1P49769 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psen1P49769 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psen1P49769 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psen1P49769 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psen1P49769 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psen1P49769 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms