Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GastP48757 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GastP48757 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GastP48757 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GastP48757 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GastP48757 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GastP48757 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GastP48757 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GastP48757 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GastP48757 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GastP48757 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GastP48757 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GastP48757 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GastP48757 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GastP48757 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GastP48757 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GastP48757 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GastP48757 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GastP48757 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GastP48757 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GastP48757 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GastP48757 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GastP48757 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GastP48757 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GastP48757 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GastP48757 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GastP48757 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GastP48757 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GastP48757 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GastP48757 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GastP48757 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GastP48757 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GastP48757 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GastP48757 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GastP48757 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GastP48757 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GastP48757 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GastP48757 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GastP48757 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GastP48757 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GastP48757 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GastP48757 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GastP48757 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GastP48757 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GastP48757 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GastP48757 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GastP48757 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GastP48757 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GastP48757 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GastP48757 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GastP48757 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GastP48757 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GastP48757 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GastP48757 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GastP48757 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GastP48757 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GastP48757 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GastP48757 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GastP48757 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GastP48757 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GastP48757 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GastP48757 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GastP48757 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GastP48757 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GastP48757 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GastP48757 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GastP48757 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GastP48757 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GastP48757 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GastP48757 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GastP48757 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GastP48757 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GastP48757 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GastP48757 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GastP48757 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GastP48757 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GastP48757 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GastP48757 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GastP48757 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GastP48757 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GastP48757 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GastP48757 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GastP48757 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GastP48757 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GastP48757 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GastP48757 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GastP48757 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GastP48757 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GastP48757 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GastP48757 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GastP48757 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GastP48757 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GastP48757 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GastP48757 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GastP48757 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GastP48757 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GastP48757 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GastP48757 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GastP48757 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GastP48757 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms