Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LmnaP48678 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LmnaP48678 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LmnaP48678 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LmnaP48678 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LmnaP48678 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LmnaP48678 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LmnaP48678 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LmnaP48678 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LmnaP48678 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LmnaP48678 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LmnaP48678 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LmnaP48678 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LmnaP48678 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LmnaP48678 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LmnaP48678 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LmnaP48678 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LmnaP48678 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LmnaP48678 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LmnaP48678 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LmnaP48678 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LmnaP48678 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LmnaP48678 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LmnaP48678 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LmnaP48678 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LmnaP48678 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LmnaP48678 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LmnaP48678 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LmnaP48678 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LmnaP48678 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LmnaP48678 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LmnaP48678 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LmnaP48678 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LmnaP48678 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LmnaP48678 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LmnaP48678 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LmnaP48678 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LmnaP48678 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LmnaP48678 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LmnaP48678 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LmnaP48678 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LmnaP48678 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LmnaP48678 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LmnaP48678 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LmnaP48678 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LmnaP48678 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LmnaP48678 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LmnaP48678 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LmnaP48678 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LmnaP48678 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LmnaP48678 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LmnaP48678 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LmnaP48678 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LmnaP48678 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LmnaP48678 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LmnaP48678 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LmnaP48678 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LmnaP48678 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LmnaP48678 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LmnaP48678 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LmnaP48678 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LmnaP48678 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LmnaP48678 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LmnaP48678 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LmnaP48678 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LmnaP48678 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LmnaP48678 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LmnaP48678 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LmnaP48678 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LmnaP48678 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LmnaP48678 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LmnaP48678 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LmnaP48678 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LmnaP48678 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LmnaP48678 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LmnaP48678 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LmnaP48678 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LmnaP48678 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LmnaP48678 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LmnaP48678 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LmnaP48678 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LmnaP48678 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LmnaP48678 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LmnaP48678 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LmnaP48678 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LmnaP48678 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LmnaP48678 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LmnaP48678 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LmnaP48678 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LmnaP48678 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LmnaP48678 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms