Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capza1P47753 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capza1P47753 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capza1P47753 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capza1P47753 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capza1P47753 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capza1P47753 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capza1P47753 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capza1P47753 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capza1P47753 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capza1P47753 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Capza1P47753 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capza1P47753 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capza1P47753 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Capza1P47753 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capza1P47753 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capza1P47753 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capza1P47753 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capza1P47753 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capza1P47753 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capza1P47753 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capza1P47753 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capza1P47753 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capza1P47753 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capza1P47753 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Capza1P47753 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capza1P47753 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capza1P47753 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capza1P47753 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capza1P47753 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Capza1P47753 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capza1P47753 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capza1P47753 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capza1P47753 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capza1P47753 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capza1P47753 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capza1P47753 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza1P47753 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza1P47753 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capza1P47753 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capza1P47753 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capza1P47753 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capza1P47753 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capza1P47753 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capza1P47753 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capza1P47753 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capza1P47753 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms