Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sdc2P43407 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sdc2P43407 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sdc2P43407 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sdc2P43407 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sdc2P43407 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sdc2P43407 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sdc2P43407 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sdc2P43407 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sdc2P43407 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sdc2P43407 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sdc2P43407 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sdc2P43407 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sdc2P43407 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sdc2P43407 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Sdc2P43407 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sdc2P43407 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Sdc2P43407 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sdc2P43407 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sdc2P43407 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sdc2P43407 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sdc2P43407 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sdc2P43407 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sdc2P43407 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sdc2P43407 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sdc2P43407 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sdc2P43407 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sdc2P43407 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sdc2P43407 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sdc2P43407 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Sdc2P43407 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sdc2P43407 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sdc2P43407 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sdc2P43407 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sdc2P43407 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sdc2P43407 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sdc2P43407 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sdc2P43407 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sdc2P43407 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sdc2P43407 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sdc2P43407 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sdc2P43407 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sdc2P43407 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sdc2P43407 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sdc2P43407 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sdc2P43407 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sdc2P43407 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sdc2P43407 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sdc2P43407 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sdc2P43407 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sdc2P43407 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sdc2P43407 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sdc2P43407 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sdc2P43407 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sdc2P43407 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sdc2P43407 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sdc2P43407 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sdc2P43407 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sdc2P43407 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Sdc2P43407 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sdc2P43407 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sdc2P43407 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sdc2P43407 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sdc2P43407 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sdc2P43407 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sdc2P43407 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sdc2P43407 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sdc2P43407 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sdc2P43407 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sdc2P43407 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sdc2P43407 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sdc2P43407 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms