Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox6P40645 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox6P40645 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox6P40645 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox6P40645 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox6P40645 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sox6P40645 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox6P40645 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox6P40645 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox6P40645 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox6P40645 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox6P40645 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sox6P40645 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox6P40645 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox6P40645 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox6P40645 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox6P40645 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sox6P40645 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox6P40645 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox6P40645 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox6P40645 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox6P40645 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox6P40645 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox6P40645 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sox6P40645 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sox6P40645 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox6P40645 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox6P40645 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox6P40645 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox6P40645 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox6P40645 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox6P40645 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sox6P40645 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox6P40645 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox6P40645 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sox6P40645 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox6P40645 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sox6P40645 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox6P40645 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox6P40645 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox6P40645 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox6P40645 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox6P40645 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox6P40645 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox6P40645 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox6P40645 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox6P40645 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox6P40645 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox6P40645 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox6P40645 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox6P40645 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox6P40645 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox6P40645 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox6P40645 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox6P40645 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox6P40645 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox6P40645 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox6P40645 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox6P40645 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox6P40645 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox6P40645 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox6P40645 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox6P40645 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox6P40645 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox6P40645 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox6P40645 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox6P40645 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox6P40645 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox6P40645 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox6P40645 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox6P40645 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox6P40645 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox6P40645 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox6P40645 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox6P40645 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox6P40645 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox6P40645 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox6P40645 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox6P40645 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox6P40645 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms