Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Thbs1P35441 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thbs1P35441 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thbs1P35441 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thbs1P35441 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thbs1P35441 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thbs1P35441 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thbs1P35441 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thbs1P35441 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thbs1P35441 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Thbs1P35441 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thbs1P35441 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thbs1P35441 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Thbs1P35441 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Thbs1P35441 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Thbs1P35441 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Thbs1P35441 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Thbs1P35441 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Thbs1P35441 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Thbs1P35441 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Thbs1P35441 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Thbs1P35441 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Thbs1P35441 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Thbs1P35441 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Thbs1P35441 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thbs1P35441 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thbs1P35441 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Thbs1P35441 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Thbs1P35441 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Thbs1P35441 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Thbs1P35441 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Thbs1P35441 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Thbs1P35441 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Thbs1P35441 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Thbs1P35441 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Thbs1P35441 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Thbs1P35441 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Thbs1P35441 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Thbs1P35441 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thbs1P35441 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thbs1P35441 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Thbs1P35441 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Thbs1P35441 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Thbs1P35441 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Thbs1P35441 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Thbs1P35441 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Thbs1P35441 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Thbs1P35441 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Thbs1P35441 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Thbs1P35441 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Thbs1P35441 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Thbs1P35441 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Thbs1P35441 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Thbs1P35441 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Thbs1P35441 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Thbs1P35441 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Thbs1P35441 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Thbs1P35441 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Thbs1P35441 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Thbs1P35441 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Thbs1P35441 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Thbs1P35441 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Thbs1P35441 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Thbs1P35441 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms