Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rab20P35295 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab20P35295 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab20P35295 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab20P35295 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab20P35295 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab20P35295 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab20P35295 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab20P35295 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab20P35295 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab20P35295 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab20P35295 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab20P35295 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab20P35295 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab20P35295 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab20P35295 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab20P35295 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab20P35295 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab20P35295 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab20P35295 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab20P35295 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab20P35295 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab20P35295 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab20P35295 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab20P35295 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab20P35295 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab20P35295 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab20P35295 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab20P35295 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab20P35295 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab20P35295 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab20P35295 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab20P35295 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab20P35295 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab20P35295 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab20P35295 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab20P35295 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab20P35295 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab20P35295 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rab20P35295 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab20P35295 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab20P35295 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab20P35295 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab20P35295 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab20P35295 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab20P35295 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab20P35295 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab20P35295 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab20P35295 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rab20P35295 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab20P35295 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab20P35295 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab20P35295 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab20P35295 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab20P35295 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab20P35295 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rab20P35295 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab20P35295 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab20P35295 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab20P35295 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab20P35295 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rab20P35295 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rab20P35295 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rab20P35295 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab20P35295 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab20P35295 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rab20P35295 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rab20P35295 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms