Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxd8P23463 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxd8P23463 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxd8P23463 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Hoxd8P23463 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxd8P23463 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxd8P23463 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxd8P23463 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxd8P23463 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxd8P23463 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxd8P23463 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxd8P23463 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hoxd8P23463 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxd8P23463 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxd8P23463 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxd8P23463 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd8P23463 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxd8P23463 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxd8P23463 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxd8P23463 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxd8P23463 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxd8P23463 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxd8P23463 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxd8P23463 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxd8P23463 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxd8P23463 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxd8P23463 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxd8P23463 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxd8P23463 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxd8P23463 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxd8P23463 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxd8P23463 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxd8P23463 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxd8P23463 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxd8P23463 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8P23463 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8P23463 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxd8P23463 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8P23463 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxd8P23463 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8P23463 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxd8P23463 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxd8P23463 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hoxd8P23463 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxd8P23463 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxd8P23463 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxd8P23463 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxd8P23463 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxd8P23463 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxd8P23463 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd8P23463 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd8P23463 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd8P23463 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd8P23463 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxd8P23463 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxd8P23463 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd8P23463 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd8P23463 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd8P23463 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd8P23463 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd8P23463 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd8P23463 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8P23463 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8P23463 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8P23463 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxd8P23463 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxd8P23463 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxd8P23463 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxd8P23463 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxd8P23463 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxd8P23463 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxd8P23463 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd8P23463 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd8P23463 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd8P23463 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd8P23463 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd8P23463 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxd8P23463 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms