Protein–RNA interactions for Protein: P17950

Ier2, Immediate early response gene 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier2P17950 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ier2P17950 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ier2P17950 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ier2P17950 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ier2P17950 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ier2P17950 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ier2P17950 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ier2P17950 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ier2P17950 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ier2P17950 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ier2P17950 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ier2P17950 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ier2P17950 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ier2P17950 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ier2P17950 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ier2P17950 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ier2P17950 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ier2P17950 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ier2P17950 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ier2P17950 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ier2P17950 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ier2P17950 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ier2P17950 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ier2P17950 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ier2P17950 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ier2P17950 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ier2P17950 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ier2P17950 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ier2P17950 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier2P17950 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier2P17950 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ier2P17950 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ier2P17950 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier2P17950 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ier2P17950 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ier2P17950 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ier2P17950 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ier2P17950 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ier2P17950 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ier2P17950 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ier2P17950 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ier2P17950 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ier2P17950 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ier2P17950 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ier2P17950 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ier2P17950 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ier2P17950 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ier2P17950 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ier2P17950 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ier2P17950 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ier2P17950 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ier2P17950 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ier2P17950 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ier2P17950 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ier2P17950 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ier2P17950 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ier2P17950 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ier2P17950 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms