Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pou4f1P17208 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pou4f1P17208 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pou4f1P17208 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pou4f1P17208 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pou4f1P17208 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pou4f1P17208 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pou4f1P17208 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pou4f1P17208 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pou4f1P17208 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou4f1P17208 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pou4f1P17208 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pou4f1P17208 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pou4f1P17208 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pou4f1P17208 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pou4f1P17208 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pou4f1P17208 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pou4f1P17208 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pou4f1P17208 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pou4f1P17208 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pou4f1P17208 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou4f1P17208 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou4f1P17208 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou4f1P17208 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pou4f1P17208 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou4f1P17208 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pou4f1P17208 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou4f1P17208 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pou4f1P17208 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pou4f1P17208 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pou4f1P17208 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou4f1P17208 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pou4f1P17208 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pou4f1P17208 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pou4f1P17208 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pou4f1P17208 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pou4f1P17208 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pou4f1P17208 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pou4f1P17208 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pou4f1P17208 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pou4f1P17208 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pou4f1P17208 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pou4f1P17208 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pou4f1P17208 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pou4f1P17208 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pou4f1P17208 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pou4f1P17208 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pou4f1P17208 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pou4f1P17208 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pou4f1P17208 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pou4f1P17208 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pou4f1P17208 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pou4f1P17208 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pou4f1P17208 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pou4f1P17208 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pou4f1P17208 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pou4f1P17208 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pou4f1P17208 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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