Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P10404 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P10404 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P10404 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P10404 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P10404 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P10404 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P10404 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
P10404 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P10404 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P10404 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P10404 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P10404 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P10404 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P10404 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
P10404 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P10404 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P10404 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P10404 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P10404 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P10404 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P10404 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P10404 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P10404 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P10404 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P10404 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P10404 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P10404 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P10404 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P10404 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P10404 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P10404 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P10404 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P10404 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P10404 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P10404 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P10404 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P10404 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P10404 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P10404 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P10404 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
P10404 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P10404 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P10404 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P10404 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P10404 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
P10404 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P10404 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P10404 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P10404 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
P10404 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P10404 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P10404 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P10404 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P10404 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P10404 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P10404 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P10404 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P10404 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P10404 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P10404 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P10404 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P10404 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P10404 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P10404 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P10404 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P10404 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P10404 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P10404 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P10404 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P10404 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P10404 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
P10404 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P10404 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P10404 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P10404 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P10404 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P10404 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P10404 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P10404 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P10404 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P10404 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P10404 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P10404 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P10404 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P10404 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P10404 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P10404 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
P10404 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P10404 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P10404 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P10404 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P10404 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P10404 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P10404 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P10404 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P10404 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P10404 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P10404 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P10404 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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