Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Surf1P09925 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Surf1P09925 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Surf1P09925 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Surf1P09925 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Surf1P09925 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Surf1P09925 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Surf1P09925 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Surf1P09925 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Surf1P09925 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Surf1P09925 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Surf1P09925 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Surf1P09925 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Surf1P09925 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Surf1P09925 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Surf1P09925 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Surf1P09925 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Surf1P09925 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Surf1P09925 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Surf1P09925 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Surf1P09925 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Surf1P09925 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Surf1P09925 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Surf1P09925 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Surf1P09925 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Surf1P09925 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Surf1P09925 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Surf1P09925 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Surf1P09925 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Surf1P09925 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Surf1P09925 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Surf1P09925 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Surf1P09925 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Surf1P09925 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Surf1P09925 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Surf1P09925 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Surf1P09925 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Surf1P09925 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Surf1P09925 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Surf1P09925 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Surf1P09925 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Surf1P09925 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Surf1P09925 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Surf1P09925 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Surf1P09925 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Surf1P09925 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Surf1P09925 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Surf1P09925 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Surf1P09925 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Surf1P09925 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Surf1P09925 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Surf1P09925 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Surf1P09925 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Surf1P09925 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Surf1P09925 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Surf1P09925 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Surf1P09925 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Surf1P09925 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Surf1P09925 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Surf1P09925 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Surf1P09925 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Surf1P09925 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Surf1P09925 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Surf1P09925 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Surf1P09925 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Surf1P09925 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Surf1P09925 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Surf1P09925 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Surf1P09925 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Surf1P09925 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Surf1P09925 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Surf1P09925 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Surf1P09925 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Surf1P09925 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Surf1P09925 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Surf1P09925 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Surf1P09925 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Surf1P09925 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Surf1P09925 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms