Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa6P09092 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa6P09092 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa6P09092 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa6P09092 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa6P09092 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa6P09092 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa6P09092 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa6P09092 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa6P09092 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxa6P09092 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa6P09092 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa6P09092 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa6P09092 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa6P09092 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa6P09092 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa6P09092 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa6P09092 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa6P09092 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa6P09092 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa6P09092 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa6P09092 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa6P09092 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa6P09092 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa6P09092 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa6P09092 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa6P09092 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa6P09092 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa6P09092 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa6P09092 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa6P09092 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa6P09092 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa6P09092 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa6P09092 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa6P09092 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa6P09092 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa6P09092 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa6P09092 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa6P09092 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa6P09092 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa6P09092 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa6P09092 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa6P09092 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa6P09092 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa6P09092 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa6P09092 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa6P09092 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa6P09092 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa6P09092 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa6P09092 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa6P09092 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa6P09092 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa6P09092 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa6P09092 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa6P09092 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa6P09092 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa6P09092 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa6P09092 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa6P09092 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa6P09092 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa6P09092 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms