Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Hoxa6P09092 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxa6P09092 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hoxa6P09092 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxa6P09092 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxa6P09092 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxa6P09092 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxa6P09092 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxa6P09092 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxa6P09092 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxa6P09092 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxa6P09092 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hoxa6P09092 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxa6P09092 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxa6P09092 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxa6P09092 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa6P09092 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxa6P09092 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxa6P09092 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa6P09092 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa6P09092 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa6P09092 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa6P09092 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxa6P09092 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa6P09092 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa6P09092 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxa6P09092 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa6P09092 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa6P09092 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxa6P09092 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxa6P09092 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa6P09092 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxa6P09092 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa6P09092 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxa6P09092 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxa6P09092 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa6P09092 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa6P09092 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa6P09092 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxa6P09092 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa6P09092 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa6P09092 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa6P09092 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa6P09092 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa6P09092 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa6P09092 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa6P09092 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa6P09092 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa6P09092 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa6P09092 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa6P09092 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa6P09092 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxa6P09092 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa6P09092 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa6P09092 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa6P09092 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa6P09092 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa6P09092 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa6P09092 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa6P09092 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa6P09092 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa6P09092 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa6P09092 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa6P09092 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa6P09092 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxa6P09092 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa6P09092 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxa6P09092 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa6P09092 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa6P09092 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa6P09092 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa6P09092 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa6P09092 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa6P09092 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa6P09092 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa6P09092 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa6P09092 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa6P09092 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa6P09092 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa6P09092 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa6P09092 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa6P09092 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa6P09092 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa6P09092 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa6P09092 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxa6P09092 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa6P09092 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa6P09092 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa6P09092 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa6P09092 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa6P09092 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa6P09092 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa6P09092 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa6P09092 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa6P09092 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa6P09092 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa6P09092 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa6P09092 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa6P09092 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa6P09092 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms