Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgfb1P04202 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgfb1P04202 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgfb1P04202 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfb1P04202 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1P04202 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1P04202 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfb1P04202 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgfb1P04202 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgfb1P04202 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1P04202 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfb1P04202 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfb1P04202 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1P04202 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfb1P04202 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfb1P04202 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfb1P04202 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfb1P04202 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfb1P04202 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tgfb1P04202 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tgfb1P04202 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1P04202 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1P04202 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfb1P04202 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tgfb1P04202 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgfb1P04202 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgfb1P04202 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfb1P04202 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfb1P04202 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgfb1P04202 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfb1P04202 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgfb1P04202 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgfb1P04202 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfb1P04202 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgfb1P04202 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tgfb1P04202 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tgfb1P04202 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tgfb1P04202 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tgfb1P04202 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tgfb1P04202 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgfb1P04202 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgfb1P04202 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgfb1P04202 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgfb1P04202 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgfb1P04202 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tgfb1P04202 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgfb1P04202 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgfb1P04202 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgfb1P04202 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgfb1P04202 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgfb1P04202 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgfb1P04202 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgfb1P04202 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgfb1P04202 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgfb1P04202 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms