Protein–RNA interactions for Protein: P01869

Ighg1, Ig gamma-1 chain C region, membrane-bound form, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg1P01869 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ighg1P01869 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ighg1P01869 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighg1P01869 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ighg1P01869 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ighg1P01869 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighg1P01869 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighg1P01869 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighg1P01869 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighg1P01869 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ighg1P01869 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighg1P01869 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighg1P01869 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighg1P01869 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighg1P01869 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ighg1P01869 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ighg1P01869 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ighg1P01869 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ighg1P01869 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ighg1P01869 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ighg1P01869 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ighg1P01869 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighg1P01869 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighg1P01869 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ighg1P01869 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighg1P01869 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighg1P01869 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighg1P01869 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighg1P01869 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighg1P01869 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighg1P01869 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighg1P01869 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighg1P01869 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighg1P01869 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighg1P01869 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighg1P01869 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighg1P01869 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighg1P01869 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighg1P01869 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighg1P01869 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighg1P01869 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighg1P01869 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighg1P01869 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighg1P01869 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighg1P01869 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighg1P01869 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighg1P01869 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighg1P01869 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighg1P01869 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ighg1P01869 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighg1P01869 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighg1P01869 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighg1P01869 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighg1P01869 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighg1P01869 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighg1P01869 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighg1P01869 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighg1P01869 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ighg1P01869 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighg1P01869 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms