Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P01747 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01747 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P01747 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01747 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01747 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01747 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01747 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01747 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01747 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01747 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01747 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01747 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
P01747 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01747 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01747 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01747 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01747 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01747 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01747 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01747 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01747 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01747 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01747 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01747 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01747 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01747 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01747 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01747 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01747 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01747 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01747 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01747 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01747 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01747 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01747 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01747 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01747 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01747 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P01747 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
P01747 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
P01747 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
P01747 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P01747 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P01747 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P01747 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
P01747 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P01747 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P01747 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
P01747 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P01747 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
P01747 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
P01747 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
P01747 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
P01747 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P01747 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P01747 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
P01747 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
P01747 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P01747 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01747 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01747 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
P01747 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01747 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01747 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01747 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01747 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01747 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01747 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01747 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01747 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01747 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01747 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
P01747 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01747 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01747 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01747 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01747 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
P01747 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01747 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
P01747 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01747 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01747 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01747 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01747 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01747 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
P01747 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01747 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01747 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01747 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01747 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01747 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01747 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01747 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01747 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01747 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01747 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01747 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01747 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01747 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms