Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01735 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01735 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01735 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01735 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01735 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01735 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01735 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01735 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
P01735 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01735 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01735 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01735 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01735 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01735 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01735 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01735 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01735 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01735 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
P01735 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
P01735 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01735 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01735 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01735 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01735 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01735 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01735 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01735 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01735 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01735 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01735 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01735 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P01735 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01735 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01735 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01735 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P01735 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P01735 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01735 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01735 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01735 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01735 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
P01735 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01735 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01735 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01735 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01735 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01735 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01735 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01735 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01735 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01735 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01735 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01735 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01735 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01735 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
P01735 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01735 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01735 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01735 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01735 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01735 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01735 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01735 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01735 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01735 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01735 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01735 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01735 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01735 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01735 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01735 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01735 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01735 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01735 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01735 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01735 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01735 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01735 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01735 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01735 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01735 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01735 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01735 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01735 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01735 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01735 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01735 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P01735 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01735 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01735 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01735 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01735 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01735 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01735 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01735 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01735 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P01735 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01735 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01735 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms