Protein–RNA interactions for Protein: O89029

Matn4, Matrilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn4O89029 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Matn4O89029 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Matn4O89029 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Matn4O89029 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Matn4O89029 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Matn4O89029 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Matn4O89029 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matn4O89029 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matn4O89029 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matn4O89029 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matn4O89029 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matn4O89029 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Matn4O89029 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Matn4O89029 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Matn4O89029 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Matn4O89029 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Matn4O89029 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Matn4O89029 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Matn4O89029 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Matn4O89029 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Matn4O89029 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Matn4O89029 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Matn4O89029 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Matn4O89029 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Matn4O89029 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Matn4O89029 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Matn4O89029 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Matn4O89029 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Matn4O89029 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Matn4O89029 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Matn4O89029 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Matn4O89029 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Matn4O89029 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matn4O89029 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Matn4O89029 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Matn4O89029 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Matn4O89029 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Matn4O89029 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Matn4O89029 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Matn4O89029 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Matn4O89029 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matn4O89029 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matn4O89029 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matn4O89029 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matn4O89029 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matn4O89029 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Matn4O89029 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Matn4O89029 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matn4O89029 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matn4O89029 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matn4O89029 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Matn4O89029 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Matn4O89029 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matn4O89029 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Matn4O89029 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matn4O89029 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matn4O89029 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matn4O89029 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matn4O89029 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matn4O89029 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matn4O89029 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matn4O89029 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn4O89029 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn4O89029 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Matn4O89029 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Matn4O89029 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn4O89029 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn4O89029 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Matn4O89029 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matn4O89029 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms