Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Stag3O70576 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Stag3O70576 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Stag3O70576 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Stag3O70576 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Stag3O70576 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Stag3O70576 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Stag3O70576 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Stag3O70576 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Stag3O70576 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Stag3O70576 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Stag3O70576 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Stag3O70576 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Stag3O70576 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Stag3O70576 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Stag3O70576 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Stag3O70576 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Stag3O70576 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Stag3O70576 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Stag3O70576 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Stag3O70576 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Stag3O70576 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Stag3O70576 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Stag3O70576 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Stag3O70576 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Stag3O70576 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Stag3O70576 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Stag3O70576 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Stag3O70576 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Stag3O70576 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Stag3O70576 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Stag3O70576 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Stag3O70576 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Stag3O70576 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Stag3O70576 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Stag3O70576 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Stag3O70576 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Stag3O70576 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Stag3O70576 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Stag3O70576 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Stag3O70576 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Stag3O70576 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Stag3O70576 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Stag3O70576 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Stag3O70576 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Stag3O70576 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Stag3O70576 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Stag3O70576 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Stag3O70576 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Stag3O70576 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Stag3O70576 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Stag3O70576 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Stag3O70576 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Stag3O70576 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Stag3O70576 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Stag3O70576 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Stag3O70576 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Stag3O70576 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Stag3O70576 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Stag3O70576 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Stag3O70576 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Stag3O70576 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Stag3O70576 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Stag3O70576 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Stag3O70576 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Stag3O70576 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Stag3O70576 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Stag3O70576 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Stag3O70576 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Stag3O70576 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Stag3O70576 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Stag3O70576 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Stag3O70576 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Stag3O70576 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Stag3O70576 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Stag3O70576 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Stag3O70576 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Stag3O70576 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Stag3O70576 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Stag3O70576 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Stag3O70576 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Stag3O70576 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Stag3O70576 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Stag3O70576 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Stag3O70576 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Stag3O70576 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Stag3O70576 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Stag3O70576 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Stag3O70576 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Stag3O70576 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Stag3O70576 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Stag3O70576 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Stag3O70576 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Stag3O70576 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Stag3O70576 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Stag3O70576 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Stag3O70576 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Stag3O70576 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Stag3O70576 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Stag3O70576 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms