Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lnx1O70263 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
Lnx1O70263 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lnx1O70263 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lnx1O70263 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lnx1O70263 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lnx1O70263 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Lnx1O70263 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lnx1O70263 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lnx1O70263 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lnx1O70263 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lnx1O70263 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms