Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BckdkO55028 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BckdkO55028 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BckdkO55028 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BckdkO55028 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BckdkO55028 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BckdkO55028 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BckdkO55028 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BckdkO55028 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BckdkO55028 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BckdkO55028 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BckdkO55028 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BckdkO55028 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BckdkO55028 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BckdkO55028 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BckdkO55028 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BckdkO55028 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BckdkO55028 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BckdkO55028 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BckdkO55028 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BckdkO55028 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BckdkO55028 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BckdkO55028 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BckdkO55028 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BckdkO55028 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BckdkO55028 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BckdkO55028 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BckdkO55028 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BckdkO55028 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BckdkO55028 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BckdkO55028 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BckdkO55028 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BckdkO55028 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BckdkO55028 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BckdkO55028 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BckdkO55028 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BckdkO55028 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BckdkO55028 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BckdkO55028 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BckdkO55028 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BckdkO55028 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BckdkO55028 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BckdkO55028 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BckdkO55028 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BckdkO55028 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BckdkO55028 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BckdkO55028 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BckdkO55028 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BckdkO55028 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BckdkO55028 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BckdkO55028 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BckdkO55028 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BckdkO55028 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BckdkO55028 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BckdkO55028 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BckdkO55028 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BckdkO55028 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BckdkO55028 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BckdkO55028 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BckdkO55028 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BckdkO55028 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BckdkO55028 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BckdkO55028 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BckdkO55028 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BckdkO55028 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BckdkO55028 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BckdkO55028 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BckdkO55028 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BckdkO55028 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BckdkO55028 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BckdkO55028 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BckdkO55028 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BckdkO55028 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BckdkO55028 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BckdkO55028 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BckdkO55028 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BckdkO55028 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BckdkO55028 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BckdkO55028 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BckdkO55028 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BckdkO55028 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BckdkO55028 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BckdkO55028 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BckdkO55028 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BckdkO55028 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BckdkO55028 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BckdkO55028 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BckdkO55028 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BckdkO55028 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BckdkO55028 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BckdkO55028 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms