Protein–RNA interactions for Protein: O35648

Cetn3, Centrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn3O35648 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cetn3O35648 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cetn3O35648 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cetn3O35648 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cetn3O35648 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cetn3O35648 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cetn3O35648 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cetn3O35648 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cetn3O35648 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cetn3O35648 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cetn3O35648 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cetn3O35648 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cetn3O35648 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cetn3O35648 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cetn3O35648 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cetn3O35648 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cetn3O35648 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cetn3O35648 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cetn3O35648 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cetn3O35648 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cetn3O35648 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cetn3O35648 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cetn3O35648 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cetn3O35648 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cetn3O35648 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cetn3O35648 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cetn3O35648 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cetn3O35648 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cetn3O35648 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cetn3O35648 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cetn3O35648 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cetn3O35648 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cetn3O35648 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cetn3O35648 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cetn3O35648 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cetn3O35648 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cetn3O35648 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cetn3O35648 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cetn3O35648 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cetn3O35648 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cetn3O35648 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cetn3O35648 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cetn3O35648 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cetn3O35648 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cetn3O35648 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cetn3O35648 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cetn3O35648 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cetn3O35648 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cetn3O35648 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cetn3O35648 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cetn3O35648 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cetn3O35648 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cetn3O35648 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cetn3O35648 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cetn3O35648 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cetn3O35648 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cetn3O35648 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cetn3O35648 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cetn3O35648 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cetn3O35648 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cetn3O35648 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cetn3O35648 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cetn3O35648 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cetn3O35648 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cetn3O35648 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cetn3O35648 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cetn3O35648 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cetn3O35648 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cetn3O35648 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cetn3O35648 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms