Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif1cO35071 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kif1cO35071 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif1cO35071 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif1cO35071 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif1cO35071 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kif1cO35071 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif1cO35071 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif1cO35071 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif1cO35071 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif1cO35071 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif1cO35071 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif1cO35071 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif1cO35071 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kif1cO35071 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif1cO35071 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif1cO35071 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif1cO35071 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif1cO35071 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif1cO35071 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif1cO35071 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif1cO35071 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif1cO35071 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kif1cO35071 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kif1cO35071 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif1cO35071 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif1cO35071 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif1cO35071 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif1cO35071 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif1cO35071 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif1cO35071 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif1cO35071 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif1cO35071 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif1cO35071 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kif1cO35071 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif1cO35071 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kif1cO35071 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif1cO35071 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif1cO35071 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif1cO35071 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif1cO35071 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif1cO35071 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif1cO35071 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif1cO35071 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif1cO35071 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif1cO35071 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif1cO35071 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif1cO35071 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif1cO35071 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kif1cO35071 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif1cO35071 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif1cO35071 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif1cO35071 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif1cO35071 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif1cO35071 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif1cO35071 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif1cO35071 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif1cO35071 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif1cO35071 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms