Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Efna3O08545 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efna3O08545 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Efna3O08545 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna3O08545 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna3O08545 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efna3O08545 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efna3O08545 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna3O08545 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna3O08545 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna3O08545 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna3O08545 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efna3O08545 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efna3O08545 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efna3O08545 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efna3O08545 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efna3O08545 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna3O08545 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna3O08545 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna3O08545 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna3O08545 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efna3O08545 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efna3O08545 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efna3O08545 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efna3O08545 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efna3O08545 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Efna3O08545 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Efna3O08545 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Efna3O08545 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efna3O08545 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efna3O08545 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Efna3O08545 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Efna3O08545 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Efna3O08545 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efna3O08545 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efna3O08545 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Efna3O08545 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Efna3O08545 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efna3O08545 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efna3O08545 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efna3O08545 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Efna3O08545 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Efna3O08545 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efna3O08545 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efna3O08545 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Efna3O08545 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Efna3O08545 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Efna3O08545 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Efna3O08545 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efna3O08545 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efna3O08545 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efna3O08545 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efna3O08545 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna3O08545 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna3O08545 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna3O08545 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna3O08545 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna3O08545 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efna3O08545 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna3O08545 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna3O08545 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna3O08545 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms