Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm8906L7N2A2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8906L7N2A2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8906L7N2A2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8906L7N2A2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8906L7N2A2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8906L7N2A2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8906L7N2A2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8906L7N2A2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8906L7N2A2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8906L7N2A2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8906L7N2A2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8906L7N2A2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8906L7N2A2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8906L7N2A2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8906L7N2A2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8906L7N2A2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8906L7N2A2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8906L7N2A2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8906L7N2A2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8906L7N2A2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8906L7N2A2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8906L7N2A2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8906L7N2A2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8906L7N2A2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8906L7N2A2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8906L7N2A2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8906L7N2A2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8906L7N2A2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8906L7N2A2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8906L7N2A2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8906L7N2A2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8906L7N2A2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8906L7N2A2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8906L7N2A2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8906L7N2A2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8906L7N2A2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8906L7N2A2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8906L7N2A2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8906L7N2A2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8906L7N2A2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8906L7N2A2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm8906L7N2A2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm8906L7N2A2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8906L7N2A2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8906L7N2A2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms