Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8857L7N291 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8857L7N291 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm8857L7N291 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8857L7N291 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8857L7N291 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8857L7N291 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8857L7N291 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8857L7N291 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8857L7N291 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8857L7N291 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8857L7N291 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8857L7N291 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8857L7N291 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8857L7N291 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8857L7N291 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8857L7N291 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8857L7N291 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8857L7N291 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8857L7N291 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8857L7N291 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8857L7N291 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8857L7N291 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8857L7N291 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8857L7N291 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8857L7N291 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8857L7N291 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8857L7N291 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8857L7N291 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8857L7N291 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8857L7N291 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8857L7N291 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8857L7N291 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8857L7N291 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8857L7N291 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8857L7N291 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8857L7N291 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8857L7N291 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8857L7N291 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8857L7N291 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8857L7N291 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8857L7N291 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8857L7N291 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8857L7N291 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8857L7N291 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8857L7N291 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8857L7N291 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8857L7N291 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8857L7N291 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8857L7N291 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8857L7N291 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms