Protein–RNA interactions for Protein: K7N731

Vmn1r57, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r57K7N731 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r57K7N731 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r57K7N731 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r57K7N731 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r57K7N731 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r57K7N731 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r57K7N731 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r57K7N731 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r57K7N731 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r57K7N731 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r57K7N731 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r57K7N731 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r57K7N731 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r57K7N731 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r57K7N731 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r57K7N731 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r57K7N731 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r57K7N731 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r57K7N731 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r57K7N731 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r57K7N731 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r57K7N731 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r57K7N731 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r57K7N731 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r57K7N731 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r57K7N731 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r57K7N731 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r57K7N731 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r57K7N731 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r57K7N731 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r57K7N731 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r57K7N731 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r57K7N731 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r57K7N731 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r57K7N731 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r57K7N731 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r57K7N731 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r57K7N731 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r57K7N731 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r57K7N731 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r57K7N731 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r57K7N731 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r57K7N731 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r57K7N731 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r57K7N731 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r57K7N731 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r57K7N731 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r57K7N731 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r57K7N731 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r57K7N731 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r57K7N731 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn1r57K7N731 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r57K7N731 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r57K7N731 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r57K7N731 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r57K7N731 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r57K7N731 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r57K7N731 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r57K7N731 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r57K7N731 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r57K7N731 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r57K7N731 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r57K7N731 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r57K7N731 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms