Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17577J3QNF7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms