Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp870J3QMA4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp870J3QMA4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp870J3QMA4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp870J3QMA4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp870J3QMA4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp870J3QMA4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp870J3QMA4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp870J3QMA4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp870J3QMA4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp870J3QMA4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp870J3QMA4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp870J3QMA4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp870J3QMA4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp870J3QMA4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp870J3QMA4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zfp870J3QMA4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp870J3QMA4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp870J3QMA4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp870J3QMA4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp870J3QMA4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp870J3QMA4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp870J3QMA4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp870J3QMA4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp870J3QMA4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp870J3QMA4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp870J3QMA4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp870J3QMA4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp870J3QMA4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp870J3QMA4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp870J3QMA4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp870J3QMA4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp870J3QMA4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp870J3QMA4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp870J3QMA4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfp870J3QMA4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp870J3QMA4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp870J3QMA4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp870J3QMA4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp870J3QMA4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp870J3QMA4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp870J3QMA4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp870J3QMA4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp870J3QMA4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp870J3QMA4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp870J3QMA4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp870J3QMA4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp870J3QMA4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp870J3QMA4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp870J3QMA4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp870J3QMA4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp870J3QMA4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zfp870J3QMA4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp870J3QMA4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms