Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r67G5E8C1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r67G5E8C1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r67G5E8C1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r67G5E8C1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r67G5E8C1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r67G5E8C1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r67G5E8C1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r67G5E8C1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r67G5E8C1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r67G5E8C1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r67G5E8C1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r67G5E8C1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r67G5E8C1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r67G5E8C1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r67G5E8C1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r67G5E8C1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r67G5E8C1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r67G5E8C1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r67G5E8C1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r67G5E8C1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r67G5E8C1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r67G5E8C1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r67G5E8C1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r67G5E8C1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r67G5E8C1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r67G5E8C1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r67G5E8C1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r67G5E8C1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r67G5E8C1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r67G5E8C1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r67G5E8C1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r67G5E8C1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r67G5E8C1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r67G5E8C1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r67G5E8C1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r67G5E8C1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r67G5E8C1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r67G5E8C1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r67G5E8C1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r67G5E8C1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r67G5E8C1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r67G5E8C1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r67G5E8C1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r67G5E8C1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r67G5E8C1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r67G5E8C1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r67G5E8C1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r67G5E8C1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r67G5E8C1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r67G5E8C1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r67G5E8C1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r67G5E8C1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r67G5E8C1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r67G5E8C1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r67G5E8C1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r67G5E8C1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r67G5E8C1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r67G5E8C1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r67G5E8C1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r67G5E8C1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r67G5E8C1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r67G5E8C1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r67G5E8C1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r67G5E8C1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r67G5E8C1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r67G5E8C1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r67G5E8C1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r67G5E8C1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms