Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Pnmal2G3X9N3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pnmal2G3X9N3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pnmal2G3X9N3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pnmal2G3X9N3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pnmal2G3X9N3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pnmal2G3X9N3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pnmal2G3X9N3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pnmal2G3X9N3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Pnmal2G3X9N3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pnmal2G3X9N3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pnmal2G3X9N3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pnmal2G3X9N3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Pnmal2G3X9N3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pnmal2G3X9N3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pnmal2G3X9N3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pnmal2G3X9N3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pnmal2G3X9N3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Pnmal2G3X9N3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pnmal2G3X9N3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pnmal2G3X9N3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pnmal2G3X9N3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pnmal2G3X9N3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pnmal2G3X9N3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pnmal2G3X9N3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Pnmal2G3X9N3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Pnmal2G3X9N3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pnmal2G3X9N3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pnmal2G3X9N3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pnmal2G3X9N3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pnmal2G3X9N3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pnmal2G3X9N3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pnmal2G3X9N3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Pnmal2G3X9N3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Pnmal2G3X9N3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Pnmal2G3X9N3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Pnmal2G3X9N3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Pnmal2G3X9N3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Pnmal2G3X9N3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Pnmal2G3X9N3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pnmal2G3X9N3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pnmal2G3X9N3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pnmal2G3X9N3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Pnmal2G3X9N3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Pnmal2G3X9N3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Pnmal2G3X9N3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pnmal2G3X9N3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Pnmal2G3X9N3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Pnmal2G3X9N3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Pnmal2G3X9N3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pnmal2G3X9N3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Pnmal2G3X9N3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Pnmal2G3X9N3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Pnmal2G3X9N3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Pnmal2G3X9N3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Pnmal2G3X9N3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Pnmal2G3X9N3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Pnmal2G3X9N3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Pnmal2G3X9N3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Pnmal2G3X9N3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Pnmal2G3X9N3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pnmal2G3X9N3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pnmal2G3X9N3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Pnmal2G3X9N3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pnmal2G3X9N3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Pnmal2G3X9N3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Pnmal2G3X9N3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Pnmal2G3X9N3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pnmal2G3X9N3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pnmal2G3X9N3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pnmal2G3X9N3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pnmal2G3X9N3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Pnmal2G3X9N3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pnmal2G3X9N3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pnmal2G3X9N3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pnmal2G3X9N3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pnmal2G3X9N3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pnmal2G3X9N3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pnmal2G3X9N3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pnmal2G3X9N3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pnmal2G3X9N3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pnmal2G3X9N3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pnmal2G3X9N3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pnmal2G3X9N3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pnmal2G3X9N3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pnmal2G3X9N3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Pnmal2G3X9N3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Pnmal2G3X9N3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pnmal2G3X9N3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pnmal2G3X9N3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms