Protein–RNA interactions for Protein: G3UXL2

Prps1l3, Phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps1l3G3UXL2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prps1l3G3UXL2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prps1l3G3UXL2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prps1l3G3UXL2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prps1l3G3UXL2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prps1l3G3UXL2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prps1l3G3UXL2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prps1l3G3UXL2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prps1l3G3UXL2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prps1l3G3UXL2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prps1l3G3UXL2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prps1l3G3UXL2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prps1l3G3UXL2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prps1l3G3UXL2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prps1l3G3UXL2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prps1l3G3UXL2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prps1l3G3UXL2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prps1l3G3UXL2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prps1l3G3UXL2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prps1l3G3UXL2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prps1l3G3UXL2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prps1l3G3UXL2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prps1l3G3UXL2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prps1l3G3UXL2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prps1l3G3UXL2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prps1l3G3UXL2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prps1l3G3UXL2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prps1l3G3UXL2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prps1l3G3UXL2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prps1l3G3UXL2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prps1l3G3UXL2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prps1l3G3UXL2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prps1l3G3UXL2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prps1l3G3UXL2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prps1l3G3UXL2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prps1l3G3UXL2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prps1l3G3UXL2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prps1l3G3UXL2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prps1l3G3UXL2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prps1l3G3UXL2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prps1l3G3UXL2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prps1l3G3UXL2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prps1l3G3UXL2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prps1l3G3UXL2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prps1l3G3UXL2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms