Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf165E9QAU8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf165E9QAU8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf165E9QAU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf165E9QAU8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf165E9QAU8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf165E9QAU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf165E9QAU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf165E9QAU8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf165E9QAU8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf165E9QAU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnf165E9QAU8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf165E9QAU8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf165E9QAU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf165E9QAU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf165E9QAU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf165E9QAU8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf165E9QAU8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf165E9QAU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf165E9QAU8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf165E9QAU8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf165E9QAU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf165E9QAU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf165E9QAU8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf165E9QAU8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf165E9QAU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf165E9QAU8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf165E9QAU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf165E9QAU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf165E9QAU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf165E9QAU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf165E9QAU8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf165E9QAU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf165E9QAU8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf165E9QAU8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf165E9QAU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf165E9QAU8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf165E9QAU8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf165E9QAU8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf165E9QAU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf165E9QAU8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf165E9QAU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf165E9QAU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf165E9QAU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf165E9QAU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf165E9QAU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf165E9QAU8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf165E9QAU8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf165E9QAU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf165E9QAU8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf165E9QAU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf165E9QAU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf165E9QAU8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf165E9QAU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf165E9QAU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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