Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc74aE9Q9U8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc74aE9Q9U8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc74aE9Q9U8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc74aE9Q9U8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc74aE9Q9U8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc74aE9Q9U8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc74aE9Q9U8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc74aE9Q9U8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc74aE9Q9U8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc74aE9Q9U8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc74aE9Q9U8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc74aE9Q9U8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc74aE9Q9U8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc74aE9Q9U8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc74aE9Q9U8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc74aE9Q9U8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc74aE9Q9U8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc74aE9Q9U8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc74aE9Q9U8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc74aE9Q9U8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc74aE9Q9U8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc74aE9Q9U8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc74aE9Q9U8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc74aE9Q9U8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc74aE9Q9U8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc74aE9Q9U8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc74aE9Q9U8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc74aE9Q9U8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc74aE9Q9U8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc74aE9Q9U8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc74aE9Q9U8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc74aE9Q9U8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc74aE9Q9U8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc74aE9Q9U8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc74aE9Q9U8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc74aE9Q9U8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc74aE9Q9U8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc74aE9Q9U8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc74aE9Q9U8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc74aE9Q9U8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc74aE9Q9U8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc74aE9Q9U8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc74aE9Q9U8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms