Protein–RNA interactions for Protein: E9PZZ1

Prdm13, PR domain zinc finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm13E9PZZ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm13E9PZZ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm13E9PZZ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm13E9PZZ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm13E9PZZ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm13E9PZZ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm13E9PZZ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm13E9PZZ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm13E9PZZ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm13E9PZZ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm13E9PZZ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm13E9PZZ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm13E9PZZ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm13E9PZZ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm13E9PZZ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm13E9PZZ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm13E9PZZ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm13E9PZZ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm13E9PZZ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm13E9PZZ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm13E9PZZ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm13E9PZZ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm13E9PZZ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm13E9PZZ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm13E9PZZ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm13E9PZZ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm13E9PZZ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm13E9PZZ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm13E9PZZ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm13E9PZZ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm13E9PZZ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm13E9PZZ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm13E9PZZ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm13E9PZZ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm13E9PZZ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm13E9PZZ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm13E9PZZ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm13E9PZZ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm13E9PZZ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm13E9PZZ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm13E9PZZ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm13E9PZZ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm13E9PZZ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm13E9PZZ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm13E9PZZ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm13E9PZZ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm13E9PZZ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm13E9PZZ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm13E9PZZ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm13E9PZZ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm13E9PZZ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm13E9PZZ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm13E9PZZ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm13E9PZZ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm13E9PZZ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdm13E9PZZ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms