Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim20D3Z7Q2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim20D3Z7Q2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim20D3Z7Q2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim20D3Z7Q2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim20D3Z7Q2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim20D3Z7Q2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim20D3Z7Q2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim20D3Z7Q2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim20D3Z7Q2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim20D3Z7Q2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim20D3Z7Q2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim20D3Z7Q2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim20D3Z7Q2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim20D3Z7Q2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim20D3Z7Q2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms