Protein–RNA interactions for Protein: D3YZG8

Mthfd2l, Probable bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd2lD3YZG8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mthfd2lD3YZG8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mthfd2lD3YZG8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mthfd2lD3YZG8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mthfd2lD3YZG8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mthfd2lD3YZG8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mthfd2lD3YZG8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mthfd2lD3YZG8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mthfd2lD3YZG8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mthfd2lD3YZG8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mthfd2lD3YZG8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mthfd2lD3YZG8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mthfd2lD3YZG8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mthfd2lD3YZG8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mthfd2lD3YZG8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mthfd2lD3YZG8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mthfd2lD3YZG8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mthfd2lD3YZG8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mthfd2lD3YZG8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mthfd2lD3YZG8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mthfd2lD3YZG8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mthfd2lD3YZG8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mthfd2lD3YZG8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mthfd2lD3YZG8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mthfd2lD3YZG8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mthfd2lD3YZG8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mthfd2lD3YZG8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mthfd2lD3YZG8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mthfd2lD3YZG8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mthfd2lD3YZG8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mthfd2lD3YZG8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mthfd2lD3YZG8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mthfd2lD3YZG8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mthfd2lD3YZG8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mthfd2lD3YZG8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mthfd2lD3YZG8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mthfd2lD3YZG8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mthfd2lD3YZG8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mthfd2lD3YZG8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mthfd2lD3YZG8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mthfd2lD3YZG8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mthfd2lD3YZG8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mthfd2lD3YZG8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mthfd2lD3YZG8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mthfd2lD3YZG8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mthfd2lD3YZG8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mthfd2lD3YZG8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mthfd2lD3YZG8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mthfd2lD3YZG8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mthfd2lD3YZG8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mthfd2lD3YZG8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms