Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r180B9EK86 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r180B9EK86 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r180B9EK86 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r180B9EK86 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r180B9EK86 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r180B9EK86 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r180B9EK86 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r180B9EK86 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r180B9EK86 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r180B9EK86 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r180B9EK86 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r180B9EK86 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r180B9EK86 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r180B9EK86 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r180B9EK86 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r180B9EK86 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r180B9EK86 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r180B9EK86 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r180B9EK86 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r180B9EK86 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r180B9EK86 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r180B9EK86 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r180B9EK86 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r180B9EK86 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r180B9EK86 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r180B9EK86 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r180B9EK86 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r180B9EK86 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r180B9EK86 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r180B9EK86 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r180B9EK86 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r180B9EK86 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r180B9EK86 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r180B9EK86 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r180B9EK86 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r180B9EK86 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r180B9EK86 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r180B9EK86 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r180B9EK86 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r180B9EK86 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r180B9EK86 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r180B9EK86 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r180B9EK86 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vmn1r180B9EK86 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r180B9EK86 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r180B9EK86 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms