Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Cldn34c4A2ANA3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn34c4A2ANA3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34c4A2ANA3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34c4A2ANA3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn34c4A2ANA3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34c4A2ANA3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34c4A2ANA3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn34c4A2ANA3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34c4A2ANA3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34c4A2ANA3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34c4A2ANA3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34c4A2ANA3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34c4A2ANA3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34c4A2ANA3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34c4A2ANA3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34c4A2ANA3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34c4A2ANA3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34c4A2ANA3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34c4A2ANA3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34c4A2ANA3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34c4A2ANA3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34c4A2ANA3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34c4A2ANA3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34c4A2ANA3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34c4A2ANA3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn34c4A2ANA3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn34c4A2ANA3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn34c4A2ANA3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn34c4A2ANA3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34c4A2ANA3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34c4A2ANA3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34c4A2ANA3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34c4A2ANA3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c4A2ANA3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c4A2ANA3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c4A2ANA3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34c4A2ANA3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34c4A2ANA3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34c4A2ANA3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34c4A2ANA3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34c4A2ANA3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn34c4A2ANA3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms