Protein–RNA interactions for Protein: A2A4F1

Rhox7a, Reproductive homeobox 7A, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox7aA2A4F1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox7aA2A4F1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox7aA2A4F1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox7aA2A4F1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox7aA2A4F1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox7aA2A4F1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox7aA2A4F1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox7aA2A4F1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox7aA2A4F1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox7aA2A4F1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox7aA2A4F1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox7aA2A4F1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox7aA2A4F1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox7aA2A4F1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox7aA2A4F1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox7aA2A4F1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox7aA2A4F1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox7aA2A4F1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox7aA2A4F1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox7aA2A4F1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox7aA2A4F1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox7aA2A4F1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox7aA2A4F1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox7aA2A4F1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox7aA2A4F1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox7aA2A4F1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox7aA2A4F1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox7aA2A4F1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox7aA2A4F1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox7aA2A4F1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox7aA2A4F1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox7aA2A4F1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox7aA2A4F1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhox7aA2A4F1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox7aA2A4F1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox7aA2A4F1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox7aA2A4F1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rhox7aA2A4F1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox7aA2A4F1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox7aA2A4F1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox7aA2A4F1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms