Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YD17

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YD17 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A286YD17 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A286YD17 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A286YD17 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A286YD17 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A286YD17 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A286YD17 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A286YD17 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A286YD17 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A286YD17 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A286YD17 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A286YD17 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A286YD17 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A286YD17 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A286YD17 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A286YD17 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A286YD17 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A286YD17 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A286YD17 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A286YD17 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A286YD17 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A286YD17 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A286YD17 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A286YD17 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A286YD17 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A286YD17 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A286YD17 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A286YD17 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A286YD17 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A286YD17 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A286YD17 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YD17 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A286YD17 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A286YD17 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A286YD17 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A286YD17 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A286YD17 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A286YD17 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A286YD17 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A286YD17 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A286YD17 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A286YD17 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A286YD17 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A286YD17 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A286YD17 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A286YD17 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A286YD17 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A286YD17 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YD17 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A286YD17 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A286YD17 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A286YD17 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A286YD17 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A286YD17 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A286YD17 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A286YD17 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A286YD17 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A286YD17 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A286YD17 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A286YD17 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A286YD17 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A286YD17 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A286YD17 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A286YD17 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A286YD17 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A286YD17 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A286YD17 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A286YD17 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A286YD17 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A286YD17 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A286YD17 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A286YD17 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A286YD17 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A286YD17 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A286YD17 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A286YD17 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A286YD17 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A286YD17 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms