Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms