Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ighv1-18A0A0A6YXN4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms