Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRV1

Vmn1r82, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r82A0A087WRV1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r82A0A087WRV1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r82A0A087WRV1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r82A0A087WRV1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r82A0A087WRV1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r82A0A087WRV1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r82A0A087WRV1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r82A0A087WRV1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r82A0A087WRV1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r82A0A087WRV1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r82A0A087WRV1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r82A0A087WRV1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r82A0A087WRV1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r82A0A087WRV1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r82A0A087WRV1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r82A0A087WRV1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r82A0A087WRV1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r82A0A087WRV1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r82A0A087WRV1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r82A0A087WRV1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r82A0A087WRV1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r82A0A087WRV1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r82A0A087WRV1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r82A0A087WRV1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r82A0A087WRV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r82A0A087WRV1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r82A0A087WRV1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r82A0A087WRV1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r82A0A087WRV1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r82A0A087WRV1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r82A0A087WRV1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r82A0A087WRV1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r82A0A087WRV1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r82A0A087WRV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r82A0A087WRV1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r82A0A087WRV1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r82A0A087WRV1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r82A0A087WRV1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r82A0A087WRV1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r82A0A087WRV1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r82A0A087WRV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r82A0A087WRV1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r82A0A087WRV1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms